常规的洗肠有三种，一是用生理盐水灌肠，此方法用于某些病人在进行腹部手术或照腹腔镜前的辅助措施，将病人体内的粪便彻底排出体外，以便进行手术；
二是用肥皂水灌肠，这种方法一般用于老年人便秘等疾病的治疗；
三是用药水灌肠，针对肠道有疾病的患者，一些需要在结肠吸收的药物要是通过口服等到达结肠的时候基本就没有药效了，为了保证药物到达患处的浓度，一般会在水中加入药物然后给患者灌肠，让药物在肠子内停留一段时间后，待结肠充分吸收药物后，药水才连同肠道废物一起排出体外，这种方法叫“保留灌肠”。
这里所说的洗肠是狭义的，是作为一种治疗手段而存在的。但是，如果同一性质的“洗肠法”搬到休闲场馆，用作保健美容，甚至由非专业医生操作，似乎就不太合适。
通过洗肠来洗去大便和毒素，从理论上说是对的。但人不可能经常洗肠，因为人天天要吃饭，代谢产物天天在产生。
所以，洗肠的排毒功能还是极其有限的。第二，灌多少水很有讲究，个人耐受性各不相同，稍不留神就会出问题。特别是有肠道疾病的患者，如果不慎会导致肠穿孔。第三，洗肠时要把一根导管通过肛门插入到直肠6厘米左右的深处，操作规程是严格要求一人一管，即进出水管必须是一次性使用。
如果违规操作，不仅可能破坏患者体内的酸碱平衡，甚至造成患者肠穿孔及发生逆向感染的可能。另外，灌入肠道的液体不能保证一点也不外流。如果有的人肛门括约肌比较松弛，灌入100毫升，可能要流出5毫升，特别是女性，肛门离尿道、阴道口很近，灌洗液中的大便流出时很容易污染尿道和阴道。
针对一些洗肠广告上宣传的美容、减肥、治疗糖尿并肝病甚至脚气的作用，北京军区总医院消化科主任韩英说，通便、排宿便是洗肠的直接效果，至于说美容和减肥，理论上没什么依据。脂肪的吸收在小肠已经完成了，洗结肠怎么能减肥？至于说治病，洗肠的确能缓和一些糖尿并肝病患者的并发症，但不能治本。
很多人是为了减肥去洗肠的，据说洗完后，确实可以看到漂浮的油脂物。韩主任说，这是因为大肠中的粪便是没有任何营养物质的，它只是参与大便形成以及吸收水和电解质。洗肠洗去的只是大肠中的大便及其他废物，同时也带走极少量小肠中的营养物质。当然，如果吃得太油，小肠的吸收已经达到了超饱和状态，多余的脂肪才会漏到大肠。这种情况下，人们往往可以看到有少量脂肪漂浮在水中，于是信以为真。其实排出的是粪便，并不是脂肪。
虽然机械洗肠可将肠道内该吸收的油脂和残渣排出体外，一定程度上可起到降血脂，清宿便的作用，但水疗也有禁忌症，比如痔疮出血期和炎症期，刚做完结肠手术的患者，以及肿瘤期患者和有严重心脏疾病的人均不宜接受水疗。具体操作的工作人员如果未曾受过医学培训，在遇到意外情况时不能有效地进行处理，也可能会对患者造成伤害。频繁洗肠可导致肛门括约肌更为松弛，便意不敏感，间隔时间以一年为宜，最少也要间隔半年以上。水疗还是一种辅助治疗手段，不应简单地视为生活服务。
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